Avez-vous déjà entendu parler de la levure Candida auris ? Sinon, vous n’êtes probablement pas seul car il n’a pas attiré beaucoup d’attention. Cela pourrait peut-être changer dans un avenir proche.
L’histoire de Candida auris commence en 2009 lorsqu’une Japonaise de 70 ans est admise à l’hôpital gériatrique métropolitain de Tokyo. Son oreille décharge parfois quelque chose, et les médecins utilisent régulièrement un coton-tige pour en prélever des échantillons. Pour déterminer la cause de l’infection, ils analysent l’échantillon.
Il s’avère qu’une levure, différente des autres levures connues, est en jeu. Nous avons tous entendu parler de la levure de boulanger, un micro-organisme amical utilisé pour fabriquer de la bière et du pain. Candida auris et les autres espèces de levure Candida sont extrêmement différentes; Ils provoquent des infections graves et persistantes qui sont difficiles à traiter avec des antibiotiques connus.
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Évasion dans un hôpital de Londres
Contre toute attente, Candida auris s’est avéré exceptionnellement résistant au stress. La découverte est si inhabituelle que les médecins décident de la documenter dans une revue scientifique; ils le nomment Candida auris d’après l’endroit où il a été découvert – auris signifiant oreille en latin. Depuis lors, la levure s’est répandue sur tous les continents. Les patients sont presque toujours des individus affaiblis et les incidents sont pratiquement toujours enregistrés dans les hôpitaux.
Par exemple, l’hôpital Royal Brompton de Londres a eu une infection aiguë à Candida auris hors de contrôle en 2015. L’équipe avait tout essayé pour se débarrasser des infections pendant trois mois, et finalement, ils ont lancé une attaque par pulvérisation d’une semaine. Ils ont pulvérisé du peroxyde d’hydrogène sur toutes les surfaces des pièces infectées dans l’espoir que la pulvérisation atteindrait toutes les crevasses et tous les coins.
Le dispositif de pulvérisation a fonctionné pendant une semaine, et pour tester si des micro-organismes ont survécu, une plaque enduite de gel a été placée au milieu de la pièce. Tous les micro-organismes qui ont réussi à résister à l’assaut de pulvérisation d’une semaine seront attirés par le gel et révéleront donc leur existence. Un seul organisme apparaît sur la plaque de gel. Candida auris.
Le premier cas au Danemark
En 2022, un Danois est rentré d’Afrique du Sud pour être admis dans un hôpital danois. La personne avait plusieurs blessures qui doivent être traitées, et les médecins sud-africains avaient découvert Candida auris sur la peau du patient.
La présence d’un champignon sur la peau n’est pas dangereuse en soi – elle ne le devient que lorsqu’il pénètre dans la circulation sanguine – mais l’hôpital danois a pris des mesures de sécurité supplémentaires pour s’assurer que Candida auris ne se propage pas à d’autres patients de l’hôpital: le patient a été admis dans deux chambres afin qu’il y ait également de la place pour l’équipement nécessaire aux examens. Cela a permis de s’assurer que le patient n’avait pas à être déplacé dans d’autres services.
Pour accéder aux deux chambres isolées, le personnel devait passer par deux serrures. Le patient s’est rétabli et a reçu son congé, et sur une période de 24 heures, tout a été désinfecté dans les chambres et dans les serrures.
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Quatre cas au Danemark, jusqu’à présent
Le patient suivant admis dans l’une de ces deux chambres n’y est resté que cinq heures – mais cela a suffi pour que le patient soit infecté par Candida auris dans le sang.
« Il est difficile de comprendre comment cela a pu se produire », a déclaré Maiken Cavling Arendrup, professeur et chef de l’unité de mycologie du Statens Serum Institut au Danemark, qui a suivi les cas.
À ce jour, quatre cas de Candida auris ont été enregistrés au Danemark, tous à partir de 2022. Trois cas sont sur la peau de personnes qui sont rentrées de l’étranger, tandis que le quatrième – le patient qui a été infecté après cinq heures dans la chambre d’hôpital – a été infecté dans le sang. Les trois porteurs et le patient infecté se sont rétablis.
Besoin d’un meilleur traitement
« Le problème avec cette levure, c’est qu’elle est très difficile à tuer. Il est multirésistant, et donc vous risquez des infections graves qui ne peuvent pas être traitées », a déclaré Maria Szomek du groupe de recherche de Daniel Wüstner, Département de biochimie et de biologie moléculaire, ajoutant: « Il existe de nombreux types de médicaments sur le marché qui peuvent combattre les infections fongiques – y compris Candida auris. Mais ils deviennent de moins en moins efficaces parce que Candida auris est extrêmement bon pour développer une résistance, donc le défi est maintenant de développer de meilleurs médicaments qui fonctionnent. Cela signifie un médicament, qui non seulement inhibe la croissance de la levure, mais tue en fait toutes les cellules de levure restantes.
Les médicaments existants contre Candida auris et d’autres levures ayant le potentiel de tuer les cellules sont souvent basés sur ce qu’on appelle des polyènes. Les polyènes sont un groupe de substances naturellement présentes dans certaines bactéries dans le cadre de leur système de défense inné. Les polyènes peuvent être extraits des bactéries à des fins médicales.
Pouvons-nous améliorer le système de défense de la nature?
Mais, comme le souligne Maria Szomek; Les mécanismes par lesquels les polyènes tuent la levure ne sont pas très bien compris. Ceci, cependant, est essentiel pour développer des médicaments nouveaux et améliorés à base de polyène.
« Par conséquent, nous travaillons à comprendre comment fonctionnent les polyènes de la nature », a déclaré Maria Szomek.
Ce travail a lieu dans le groupe de recherche de Daniel Wüstner au Département de biochimie et de biologie moléculaire. Dans leur laboratoire, le groupe utilise la microscopie avancée pour étudier ce qui arrive à une cellule de levure lorsqu’elle est attaquée par des polyènes. Le groupe a fait équipe avec des collègues en chimie théorique et computationnelle, Peter Reinholdt et Jacob Kongsted, et travaille également avec deux équipes de recherche allemandes à l’Université de Leipzig et à l’Université Humboldt de Berlin.
Attaque de précision dans la cellule
Les chercheurs ne travaillent pas avec de vraies cellules de Candida auris, mais plutôt avec des modèles inoffensifs, qu’ils exposent aux polyènes du fongicide Natamycine.
« Nous nous intéressons à des choses comme : comment les polyènes traversent-ils la membrane cellulaire ? Comment se lient-ils et interagissent-ils avec l’ergostérol, qui est un sous-groupe de stéroïdes et la cible de l’attaque des polyènes », a expliqué Maria Szomek.
Référence: « Natamycin sequesters ergosterol and interferes with substrate transport by the lysine transporter Lyp1 from yeast » par Maria Szomek, Peter Reinholdt, Hanna-Loisa Walther, Holger A. Scheidt, Peter Müller, Sebastian Obermaier, Bert Poolman, Jacob Kongsted et Daniel Wüstner, 29 juillet 2022, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Biomembranes.
DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.184012
L’étude a été financée par la Fondation Villum, la Fondation Lundbeck et le Fonds de recherche indépendant du Danemark.
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