Le virus nouvellement identifié infecte les bactéries vivant dans les régions les plus profondes et les plus sombres de l’océan. Les scientifiques viennent de le découvrir.
Ce nouveau virus est étonnamment persistant dans la fosse des Mariannes, l’endroit le plus profond de la Terre. Que vous souscriviez ou non à l’idée que les virus comptent en tant qu’êtres vivants, on sait peu de choses sur ceux qui en font leur maison. Dans une nouvelle étude, les chercheurs ont identifié un bactériophage jusque-là inconnu résidant dans la fosse et, ce faisant, ont élargi notre compréhension de la diversité des virus dans les profondeurs de nos eaux.
Le virus nouvellement découvert est un bactériophage (souvent abrégé en « phage »), une sorte de virus qui infecte et se réplique à l’intérieur des bactéries. Les scientifiques pensent que ce sont les organismes les plus abondants de la planète et que partout où nous trouvons des bactéries, il est fort probable que les phages soient là aussi.
Une équipe internationale de chercheurs a trouvé le phage dans les sédiments de la fosse des Mariannes, soulevés à une profondeur de 8 900 mètres. « À notre connaissance, il s’agit du phage isolé le plus profond connu dans l’océan mondial », a déclaré Min Wang, membre du groupe de recherche, dans un communiqué.
Son petit nom c’est : vB_HmeY_H4907, le phage est censé représenter une toute nouvelle famille de siphovirus, qui ont de l’ADN double brin. Il infecte Halomonas, un groupe (ou plus précisément, un genre) de bactéries que l’on trouve souvent dans les eaux profondes et dans les cheminées hydrothermales et dont on pense qu’elles jouent un rôle important dans ces environnements.
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Comme les phages et leurs bactéries hôtes co-évoluent fréquemment, les chercheurs ont mené une analyse génomique de l’ADN du nouveau phage, dans l’espoir qu’il puisse fournir des indices sur son évolution et comment il interagit avec ses hôtes Halomonas.
Les résultats de l’analyse suggèrent qu’il est largement répandu dans l’océan, mais aussi évolutifment éloigné des virus de référence utilisés. De manière significative, il s’est également avéré lysogénique – il incorpore son propre génome dans le génome de l’hôte, ce qui signifie que lorsque la cellule bactérienne se réplique et se divise, le matériel génétique viral est également copié et se retrouve dans les nouvelles cellules.
Ce remplacement de l’ADN pourrait fournir des preuves de la façon dont les deux organismes ont pu persister dans des environnements sous-marins aussi difficiles, faisant allusion à une co-évolution. Cependant, d’autres recherches sont nécessaires pour examiner pleinement cette possibilité; Les auteurs de l’étude planifient de futures recherches sur les mécanismes moléculaires à l’origine des interactions entre les virus des grands fonds marins et leurs hôtes.
Ils veulent également poursuivre la recherche de nouveaux virus dans d’autres environnements extrêmes, dans l’espoir que cela élargira la compréhension des virus et de la vie microbienne dans les grands fonds marins et au-delà.
L’étude est publiée dans Microbiology Spectrum.
